1. 平均发病年龄55岁，常单侧发生；

2. 大小不一，平均直径15cm，肿瘤外观与透明细胞腺纤维瘤相似，切面实性、囊实性或以囊性为主；

3. 由管囊状、乳头状及实性细胞增生构成，少数病例中可见显著的腺纤维瘤成分；

4. 偶尔见显著扩张的囊性结构被覆扁平细胞，给人以良性的错觉；

5. 乳头常小而形态规则，也可见大的乳头，间质玻璃样变性，乳头轴心的透明变性是透明细胞癌的典型特征；

6. 实性区含有丰富透明胞质的多边形细胞呈片状分布，并被纤细的纤维血管间质或致密的纤维间质所分隔；

7. 囊管结构为大小不等的管状和囊性结构，细胞核从乳头、腺管或囊腔突起呈靴钉样外观；

8. 细胞胞质透明或含有颗粒状嗜酸性胞质，细胞核多样，从小圆形、多角形到伴有显著核仁的大而多形性核，核分级可以从轻度到显著异型，即使肿瘤中大多数细胞仅表现为轻度核异型，但总能见到显著核异型的细胞；

9. 核分裂活性较低，仅在1/4病例中核分裂像超过10个/10HPF。

10. 可混有浆液性和黏液性肿瘤成分；

11. 肿瘤中可见多少不等的坏死、出血和间质淋巴细胞浸润；

12. 偶见黄素化的间质细胞和砂粒体样钙化；

13. 可伴有子宫内膜异位。

卵黄囊瘤（SYT）：

1. 卵黄囊瘤常发生于年轻患者，YST患者血清AFP水平升高，而透明细胞癌发病于中老年，无AFP水平升高；

2. 透明细胞癌的乳头状结构更复杂且含有透明变性的轴心，可与具有乳头样结构的YST相鉴别；

3. YST具有许多透明细胞癌没有的特点，包括特征性Schiller-Duvall小体和网状结构等；

4. 免疫组化染色：透明细胞癌LeuM1阳性和AFP阴性与YST相反；CK7和EMA同时阳性则可排除YST。

无性细胞瘤：

1. 无性细胞瘤缺乏透明细胞癌常见的腺囊型和乳头状结构，细胞核更原始；

2. 透明细胞癌缺乏无性细胞瘤常见的间质慢性炎症和肉芽肿；

3. EMA阳性和细胞角蛋白弥漫强阳性有助于排除无性细胞瘤。

浆液性肿瘤：

1. 低-中度细胞核级别的乳头型透明细胞癌可类似浆液性肿瘤： WT1和ER联合应用有助于鉴别诊断，浆液性肿瘤中这两个标记物均为阳性，而透明细胞癌常为阴性；

2. 腺囊型和乳头型结构对透明细胞癌更具特征性，即使肿瘤细胞的胞质不透明，具备上述经典结构也可以诊断为透明细胞癌。与浆液性癌相比，透明细胞癌的乳头结构更纤细、间质透明变性更常见，而浆液性癌中出现局灶肿瘤细胞胞质透明者也并不少见，如果缺乏透明细胞癌中经典的乳头状结构和腺囊状结构时，则不应诊断为透明细胞癌；

3. 高级别浆液性癌WT1、ER通常阳性，HNF-1β阴性，而透明细胞癌中WT1、ER通常阴性，HNF-1β阳性。