1. 经典型的发病年龄广泛，随着年龄增加发病增多，男女发病比例约1:10，部分患者仅表现甲状腺增大，亦可见甲状腺功能减退的临床表现，大部分患者无症状及体征，诊断需结合甲状腺功能的实验室检测、甲状腺抗体的筛选或由于其他原因的甲状腺手术切除的偶尔发现。患者可表现为肿大，典型的是双侧弥漫性肿大，仅限于一叶的肿大为主不常见。纤维亚型一般位于老年人，可能是IgG₄相关疾病谱的一部分，但未得到明确的证实，需要指出的是IgG₄相关的甲状腺炎不同于慢性淋巴细胞性（桥本）甲状腺炎的纤维亚型，男性发病多于女性，甲状腺肿大可出现吞咽困难及呼吸困难。

2. 大体上经典型呈弥漫对称性增大，质地均一，颜色稍淡，显著的多结节，切开结节一般突出切面且被纤维组织分隔。弥漫性甲状腺肿大可减少临床肿瘤性增殖的怀疑。甲状腺与周围组织无黏附。纤维亚型弥漫性肿大，质地稍硬，灰褐色，可见纤维化及显著的叶状结构，一般≥ 200 g，与周围组织无黏连。

3. 组织上经典型低倍镜下纤维组织分隔的叶状或结节状，甲状腺的弥漫性受累，甲状腺萎缩包括伴少量胶质形成至缺如的小滤泡结构。炎症细胞浸润，小叶内或周围以成熟淋巴细胞为主，混合成熟的浆细胞，可见显著的生发中心，T细胞多于B细胞，可见巨噬细胞及巨细胞。滤泡内及周围可见纤维化，小叶之间纤维化呈结节状表现，纤维化的数量常稀疏伴小叶间隔轻度至中度的增厚，纤维化程度达不到纤维亚型或Riedel甲状腺炎。滤泡上皮的胞浆嗜酸性改变，可见核增大、染色质透亮至粗糙，核呈圆形，显著的核仁。另外可见鳞状上皮化生（更常见于纤维亚型），内衬鳞状上皮或纤毛呼吸道上皮的甲状腺内囊肿可较大（常多灶及双侧），内衬细胞主要为鳞状上皮及柱状上皮，常含有杯状细胞，周边可见淋巴细胞浸润提示鳃裂囊肿可能。

4. 纤维亚型（晚期的淋巴细胞甲状腺炎）呈叶状或结节状结构伴致密的纤维化，甲状腺实质内及周边纤维化呈瘢痕样伴无细胞纤维组织的不规则带状分布，纤维化未延伸至甲状腺周围，纤维组织中可见慢性炎细胞浸润，成熟淋巴细胞浸润伴有或无生发中心，亦可见浆细胞。滤泡上皮可见萎缩、嗜酸性改变及鳞状上皮化生。

1. 非特异性慢性淋巴细胞甲状腺炎：无包块形成，散在及局灶淋巴细胞浸润，缺乏胞浆嗜酸性改变，缺乏异常甲状腺功能的实验室改变。由于其他甲状腺疾病切除之后偶尔发现。

2. 非霍奇金恶性淋巴瘤：甲状腺实质破坏，单克隆恶性细胞浸润（B细胞起源为主），肿瘤细胞浸润至甲状腺周围软组织，甲状腺可黏附于周围组织。

3. 乳头状甲状腺癌：HT无乳头状癌的诊断性核特点，BRAF突变可见于乳头状癌的35-69%，而在HT的滤泡上皮中无BRAF突变。

4. Riedel病（浸润性纤维化甲状腺炎）：纤维化常与周围组织黏连，无抗甲状腺球蛋白抗体的升高，甲状腺实质被致密瘢痕样纤维化破坏及取代，病变不只仅限于甲状腺内，亦可延伸至周围软组织，可见甲状腺滤泡上皮的萎缩，无嗜酸性改变，慢性炎细胞浸润以淋巴细胞及浆细胞为主。血管炎主要累及静脉（静脉炎）。